Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLFNL1Q499Z3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLFNL1Q499Z3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFNL1Q499Z3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms