Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNF212Q495C1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNF212Q495C1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms