Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC153Q494R4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC153Q494R4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC153Q494R4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms