Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT71Q3SY84 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT71Q3SY84 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms