Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SP6Q3SY56 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms