Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRIT3Q3SXY7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRIT3Q3SXY7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRIT3Q3SXY7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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