Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM30BQ3MIR4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM30BQ3MIR4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms