Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TWISTNBQ3B726 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TWISTNBQ3B726 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms