Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TBR1Q16650 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBR1Q16650 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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