Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB11BQ15907 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11BQ15907 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms