Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNA6Q15825 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNA6Q15825 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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