Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NPTX1Q15818 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPTX1Q15818 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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