Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3CQ15386 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UBE3CQ15386 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBE3CQ15386 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms