Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC41Q15345 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC41Q15345 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRC41Q15345 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms