Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABEP1Q15276 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABEP1Q15276 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABEP1Q15276 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms