Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMC1AQ14683 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMC1AQ14683 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC1AQ14683 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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