Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM25Q14258 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM25Q14258 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM25Q14258 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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