Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53BQ14153 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms