Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALCAMQ13740 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALCAMQ13740 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALCAMQ13740 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
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