Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NEUROD1Q13562 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NEUROD1Q13562 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NEUROD1Q13562 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
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