Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERCC8Q13216 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ERCC8Q13216 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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ERCC8Q13216 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERCC8Q13216 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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