Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H3Q13133 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H3Q13133 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H3Q13133 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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