Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDZK1IP1Q13113 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PDZK1IP1Q13113 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDZK1IP1Q13113 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms