Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PRDM2Q13029 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
PRDM2Q13029 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC40.38■■■■■ 4.06
PRDM2Q13029 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
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