Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BNIP3Q12983 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BNIP3Q12983 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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