Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWF1Q12792 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWF1Q12792 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWF1Q12792 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms