Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

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Length 764 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.64□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 MRS3YJL133W 945 nt5.64□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 RHO4YKR055W 876 nt5.64□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 MRPL22YNL177C 930 nt5.64□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 HMT1YBR034C 1047 nt5.64□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.64□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YPR098CYPR098C 486 nt5.64□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 UTP18YJL069C 1785 nt5.64□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 UGO1YDR470C 1509 nt5.64□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 UTP7YER082C 1665 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 TUL1YKL034W 2277 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 SCT1YBL011W 2280 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YDL034WYDL034W 345 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 MRP17YKL003C 396 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 PGA2YNL149C 390 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 PHA2YNL316C 1005 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YOR200WYOR200W 399 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 CPA1YOR303W 1236 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 SCP1YOR367W 603 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 PRE2YPR103W 864 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 PEX32YBR168W 1242 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 EPS1YIL005W 2106 nt5.63□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 VPS1YKR001C 2115 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 COX26YDR119W-A 201 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 RTT103YDR289C 1230 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YGR022CYGR022C 330 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 EGD2YHR193C 525 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YIL060WYIL060W 435 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 PIN2YOR104W 849 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 ALG5YPL227C 1005 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 SFB3YHR098C 2790 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 VTH1YIL173W 4650 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 VTH2YJL222W 4650 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 VPS70YJR126C 2436 nt5.62□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 TRP3YKL211C 1455 nt5.61□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YBL044WYBL044W 369 nt5.61□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 COA2YPL189C-A 207 nt5.61□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 ABZ1YNR033W 2364 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YIR007WYIR007W 2295 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 HXT3YDR345C 1704 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YBR138CYBR138C 1575 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 CLP1YOR250C 1338 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YIR043CYIR043C 693 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 RRT7YLL030C 342 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 SSP120YLR250W 705 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 MTQ1YNL063W 945 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YPR195CYPR195C 330 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 ASH1YKL185W 1767 nt5.6□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 SEC12YNR026C 1416 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 GPI18YBR004C 1302 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 PIF1YML061C 2580 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YDL119CYDL119C 924 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 UPS3YDR185C 540 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 COS9YKL219W 1224 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YKL223WYKL223W 333 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 HOR7YMR251W-A 180 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YOL079WYOL079W 399 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 SUE1YPR151C 621 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 ECM3YOR092W 1842 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 ACF2YLR144C 2340 nt5.59□□□□□ -1.51
AVL9Q12500 YHR045WYHR045W 1683 nt5.59□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 URA7YBL039C 1740 nt5.58□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 CWC21YDR482C 408 nt5.58□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 CTR2YHR175W 570 nt5.58□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 YLL059CYLL059C 507 nt5.58□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 DCN1YLR128W 810 nt5.58□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.58□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 POR1YNL055C 852 nt5.58□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 ENV9YOR246C 993 nt5.58□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 HPF1YOL155C 2904 nt5.58□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 SPC97YHR172W 2472 nt5.57□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.57□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 YLR296WYLR296W 327 nt5.57□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 MTF1YMR228W 1026 nt5.57□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 PDR16YNL231C 1056 nt5.57□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 MRPL36YBR122C 534 nt5.57□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 GSY2YLR258W 2118 nt5.57□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.57□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 DED81YHR019C 1665 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 YCR006CYCR006C 474 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 CBP4YGR174C 513 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 VMA16YHR026W 642 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 SNN1YNL086W 309 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 NPT1YOR209C 1290 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 TIP41YPR040W 1071 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 UBC4YBR082C 447 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 RET1YOR207C 3450 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 QRI1YDL103C 1434 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 RPT1YKL145W 1404 nt5.56□□□□□ -1.52
AVL9Q12500 FHL1YPR104C 2811 nt5.56□□□□□ -1.52
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