Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 RPT1YKL145W 1404 nt5.69□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 CHO1YER026C 831 nt5.69□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 COS6YGR295C 1146 nt5.69□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 RDL1YOR285W 420 nt5.69□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 DBP9YLR276C 1785 nt5.69□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 EPS1YIL005W 2106 nt5.69□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 MET7YOR241W 1647 nt5.68□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 ELA1YNL230C 1140 nt5.68□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 CAR1YPL111W 1002 nt5.68□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 ROG3YFR022W 2202 nt5.68□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 YHR045WYHR045W 1683 nt5.68□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 ACF2YLR144C 2340 nt5.68□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 TIM54YJL054W 1437 nt5.67□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 KNH1YDL049C 807 nt5.67□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 IPI1YHR085W 1005 nt5.67□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 PFA3YNL326C 1011 nt5.67□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 NSI1YDR026C 1713 nt5.67□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 TEA1YOR337W 2280 nt5.67□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 ENT2YLR206W 1842 nt5.67□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 BAP2YBR068C 1830 nt5.67□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 GSY2YLR258W 2118 nt5.66□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 ALT1YLR089C 1779 nt5.66□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 MLC1YGL106W 450 nt5.66□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 VAM7YGL212W 951 nt5.66□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 YLR118CYLR118C 684 nt5.66□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 PEX32YBR168W 1242 nt5.66□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 PIF1YML061C 2580 nt5.65□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 YKL151CYKL151C 1014 nt5.65□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 YLR122CYLR122C 378 nt5.65□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 HAL1YPR005C 885 nt5.65□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 UBC4YBR082C 447 nt5.65□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 YPR195CYPR195C 330 nt5.65□□□□□ -1.5
VPS54Q12071 RIM101YHL027W 1878 nt5.64□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 DED81YHR019C 1665 nt5.64□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 RPT6YGL048C 1218 nt5.64□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 DAL3YIR032C 588 nt5.64□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 SFC1YJR095W 969 nt5.64□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 YNL194CYNL194C 906 nt5.64□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 ODC2YOR222W 924 nt5.64□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 CDS1YBR029C 1374 nt5.64□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 TRP3YKL211C 1455 nt5.64□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 RCK1YGL158W 1539 nt5.64□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 GEP3YOR205C 1671 nt5.63□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 CST6YIL036W 1764 nt5.63□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 CBC2YPL178W 627 nt5.63□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 TAX4YJL083W 1815 nt5.62□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 MTQ2YDR140W 666 nt5.62□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 EAF5YEL018W 840 nt5.62□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 PRO3YER023W 861 nt5.62□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 POR1YNL055C 852 nt5.62□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 MTQ1YNL063W 945 nt5.62□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 KTR3YBR205W 1215 nt5.62□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 BSC5YNR069C 1470 nt5.62□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 SLO1YER180C-A 258 nt5.61□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 TDH3YGR192C 999 nt5.61□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 YHR127WYHR127W 732 nt5.61□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 PRP40YKL012W 1752 nt5.61□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 TOS4YLR183C 1470 nt5.61□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 TBF1YPL128C 1689 nt5.61□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 PHO8YDR481C 1701 nt5.6□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 SRG1SRG1 551 nt5.6□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 YDR541CYDR541C 1035 nt5.6□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.6□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 PSH1YOL054W 1221 nt5.6□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 YOR318CYOR318C 306 nt5.6□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 ELC1YPL046C 300 nt5.6□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 FET3YMR058W 1911 nt5.6□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 CTS2YDR371W 1536 nt5.59□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 PEX7YDR142C 1128 nt5.59□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 YFL064CYFL064C 525 nt5.59□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 SIP2YGL208W 1248 nt5.59□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.59□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 YNL228WYNL228W 777 nt5.59□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 YPR202WYPR202W 717 nt5.59□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 RRT2YBR246W 1164 nt5.59□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 UTP18YJL069C 1785 nt5.59□□□□□ -1.51
VPS54Q12071 SPC97YHR172W 2472 nt5.58□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 MMP1YLL061W 1752 nt5.58□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 RNR3YIL066C 2610 nt5.58□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YGR182CYGR182C 354 nt5.58□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 OXP1YKL215C 3861 nt5.57□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 VAN1YML115C 1608 nt5.57□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 SCW4YGR279C 1161 nt5.57□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 RHO3YIL118W 696 nt5.57□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YJL193WYJL193W 1209 nt5.57□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YBL044WYBL044W 369 nt5.57□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 PTR2YKR093W 1806 nt5.57□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 SEC12YNR026C 1416 nt5.57□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 VTC2YFL004W 2487 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 VTH1YIL173W 4650 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 VTH2YJL222W 4650 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 NOB1YOR056C 1380 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 FLC3YGL139W 2409 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 RHO2YNL090W 579 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 ROX3YBL093C 663 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 YCL041CYCL041C 495 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 VBA1YMR088C 1689 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 SOG2YOR353C 2376 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 FHL1YPR104C 2811 nt5.56□□□□□ -1.52
VPS54Q12071 MAL11YGR289C 1851 nt5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms