Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 MPP6YNR024W 561 nt7.97□□□□□ -1.13
TFB4Q12004 PTC6YCR079W 1329 nt7.97□□□□□ -1.13
TFB4Q12004 BCS1YDR375C 1371 nt7.97□□□□□ -1.13
TFB4Q12004 HMLALPHA1YCL066W 528 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 MATALPHA1YCR040W 528 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 RAD55YDR076W 1221 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 MOB2YFL034C-B 864 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 RSM27YGR215W 333 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 CIC1YHR052W 1131 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 LIN1YHR156C 1023 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 PEX18YHR160C 852 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 SYS1YJL004C 612 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 RSM7YJR113C 744 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 RPS10BYMR230W 318 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 CUS1YMR240C 1311 nt7.96□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 HBS1YKR084C 1836 nt7.95□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 CNN1YFR046C 1086 nt7.95□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YGR042WYGR042W 816 nt7.95□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 RRT14YIL127C 621 nt7.95□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YIM2YMR151W 438 nt7.95□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 ECM27YJR106W 2178 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 MSB3YNL293W 1902 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 SCM3YDL139C 672 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YDR290WYDR290W 330 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 DDI2YFL061W 678 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YJR011CYJR011C 786 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 BUR2YLR226W 1188 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 RRN10YBL025W 438 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 RPC19YNL113W 429 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 DDI3YNL335W 678 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 PSH1YOL054W 1221 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 CPA1YOR303W 1236 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 TRS20YBR254C 528 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 GDH1YOR375C 1365 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 BAP3YDR046C 1815 nt7.94□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 TOP3YLR234W 1971 nt7.93□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt7.93□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 APQ13YJL075C 417 nt7.93□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 CDC11YJR076C 1248 nt7.93□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt7.93□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 OGG1YML060W 1131 nt7.93□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 DYN3YMR299C 939 nt7.93□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 KGD2YDR148C 1392 nt7.93□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 GAS1YMR307W 1680 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YER156CYER156C 1017 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 SRB5YGR104C 924 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 FOL2YGR267C 732 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 SBP1YHL034C 885 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 MNN11YJL183W 1269 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 GAB1YLR459W 1185 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 POP8YBL018C 402 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 DIM1YPL266W 957 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YBR287WYBR287W 1284 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YIL177CYIL177C 5277 nt7.92□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YDR467CYDR467C 327 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 CHO1YER026C 831 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YGR226CYGR226C 210 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 CAB2YIL083C 1098 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 AIM20YIL158W 615 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 LSP1YPL004C 1026 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 GRX1YCL035C 333 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 ADA2YDR448W 1305 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 SUP45YBR143C 1314 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 ITT1YML068W 1395 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 SKS1YPL026C 1509 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 ERT1YBR239C 1590 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 REF2YDR195W 1602 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 LEU4YNL104C 1860 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 LAG2YOL025W 1983 nt7.91□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 DPL1YDR294C 1770 nt7.9□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 MTC1YJL123C 1437 nt7.9□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 MFG1YDL233W 1377 nt7.9□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YGL262WYGL262W 528 nt7.9□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YLR326WYLR326W 723 nt7.9□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 ATP19YOL077W-A 207 nt7.9□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 KAR4YCL055W 1008 nt7.9□□□□□ -1.14
TFB4Q12004 YCK1YHR135C 1617 nt7.89□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 PFA3YNL326C 1011 nt7.89□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 UFE1YOR075W 1041 nt7.89□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 CDC13YDL220C 2775 nt7.89□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 HXT7YDR342C 1713 nt7.89□□□□□ -1.15
TFB4Q12004 HXT6YDR343C 1713 nt7.89□□□□□ -1.15
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