Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CPSF1Q10570 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CPSF1Q10570 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CPSF1Q10570 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CPSF1Q10570 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
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