Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF543Q08ER8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF543Q08ER8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF543Q08ER8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms