Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRTAP1-1Q07627 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRTAP1-1Q07627 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRTAP1-1Q07627 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms