Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK18Q07002 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK18Q07002 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms