Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNDQ07001 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNDQ07001 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNDQ07001 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms