Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKCDQ05655 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCDQ05655 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKCDQ05655 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRKCDQ05655 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKCDQ05655 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRKCDQ05655 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCDQ05655 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCDQ05655 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCDQ05655 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCDQ05655 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCDQ05655 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCDQ05655 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCDQ05655 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCDQ05655 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCDQ05655 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCDQ05655 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCDQ05655 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCDQ05655 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCDQ05655 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCDQ05655 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCDQ05655 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCDQ05655 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCDQ05655 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCDQ05655 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCDQ05655 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCDQ05655 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCDQ05655 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCDQ05655 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCDQ05655 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms