Protein–RNA interactions for Protein: Q04437

YKU80, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKU80Q04437 GTO1YGR154C 1071 nt5.73□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 SFC1YJR095W 969 nt5.73□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 PSH1YOL054W 1221 nt5.73□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 ENV9YOR246C 993 nt5.73□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 FRE3YOR381W 2136 nt5.73□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 YPR114WYPR114W 948 nt5.73□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 MUM3YOR298W 1440 nt5.73□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 CLA4YNL298W 2529 nt5.73□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 YMD8YML038C 1329 nt5.73□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 YDR132CYDR132C 1488 nt5.72□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 MRPL25YGR076C 474 nt5.72□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 IML2YJL082W 2196 nt5.72□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 RRP9YPR137W 1722 nt5.71□□□□□ -1.49
YKU80Q04437 MAK31YCR020C-A 267 nt5.71□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YET3YDL072C 612 nt5.71□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 RPS16BYDL083C 432 nt5.71□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YER186CYER186C 921 nt5.71□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 HOR7YMR251W-A 180 nt5.71□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YOL035CYOL035C 303 nt5.71□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 SUE1YPR151C 621 nt5.71□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 ATG4YNL223W 1485 nt5.71□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 ECM3YOR092W 1842 nt5.7□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 HEM3YDL205C 984 nt5.7□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.7□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 RSM10YDR041W 612 nt5.7□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 URA3YEL021W 804 nt5.7□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 AAD6YFL056C 639 nt5.7□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 STM1YLR150W 822 nt5.7□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 TSR3YOR006C 942 nt5.7□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 ERG1YGR175C 1491 nt5.7□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 SSY5YJL156C 2100 nt5.69□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 ARB1YER036C 1833 nt5.69□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 SPO77YLR341W 1434 nt5.69□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 PCL6YER059W 1263 nt5.69□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 PHO86YJL117W 936 nt5.69□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 SNN1YNL086W 309 nt5.69□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 PIF1YML061C 2580 nt5.69□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 CLD1YGR110W 1338 nt5.69□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 TAX4YJL083W 1815 nt5.69□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 DBF2YGR092W 1719 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 PDH1YPR002W 1551 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 SEC12YNR026C 1416 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 VTH1YIL173W 4650 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 VTH2YJL222W 4650 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 MMS21YEL019C 804 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 BUD32YGR262C 786 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YML018CYML018C 1182 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 GTR1YML121W 933 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YMR295CYMR295C 594 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 PDR16YNL231C 1056 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 CAF40YNL288W 1122 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YOR292CYOR292C 930 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YPL014WYPL014W 1146 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 SIP5YMR140W 1470 nt5.68□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 UTP4YDR324C 2331 nt5.67□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.67□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 HVG1YER039C 750 nt5.67□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YKL031WYKL031W 414 nt5.67□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YLR463CYLR463C 552 nt5.67□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 GFD1YMR255W 567 nt5.67□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YJR124CYJR124C 1347 nt5.67□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 RPT4YOR259C 1314 nt5.67□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 GAS3YMR215W 1575 nt5.67□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YDR015CYDR015C 240 nt5.66□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YIL060WYIL060W 435 nt5.66□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 COX11YPL132W 903 nt5.66□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 RAD53YPL153C 2466 nt5.66□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 SDA1YGR245C 2304 nt5.65□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.65□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YDR541CYDR541C 1035 nt5.65□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 KSS1YGR040W 1107 nt5.65□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YHL018WYHL018W 363 nt5.65□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 SEC13YLR208W 894 nt5.65□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 RPC19YNL113W 429 nt5.65□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 YPL071CYPL071C 471 nt5.65□□□□□ -1.5
YKU80Q04437 OCA5YHL029C 2040 nt5.65□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 AMD1YML035C 2433 nt5.65□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 YDL121CYDL121C 450 nt5.64□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 MMS2YGL087C 414 nt5.64□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 PHB1YGR132C 864 nt5.64□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 NOT3YIL038C 2511 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 UBC6YER100W 753 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 ISY1YJR050W 708 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 YLR184WYLR184W 348 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 YNL285WYNL285W 372 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 RAD24YER173W 1980 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 ICE2YIL090W 1476 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 RAT1YOR048C 3021 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 DSF1YEL070W 1509 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 YNR073CYNR073C 1509 nt5.63□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 YTA12YMR089C 2478 nt5.62□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.62□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.62□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.62□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 DJP1YIR004W 1299 nt5.62□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 RNH201YNL072W 924 nt5.62□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 MDY2YOL111C 639 nt5.62□□□□□ -1.51
YKU80Q04437 CKA2YOR061W 1020 nt5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.8 ms