Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN1Q04323 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN1Q04323 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms