Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF90Q03938 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF90Q03938 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms