Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFHR1Q03591 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFHR1Q03591 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFHR1Q03591 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms