Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

Predictions only

Length 3,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 ERG12YMR208W 1332 nt5.57□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 QRI1YDL103C 1434 nt5.57□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 GPB2YAL056W 2643 nt5.56□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 YPL278CYPL278C 303 nt5.56□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 SEH1YGL100W 1050 nt5.55□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 MPH2YDL247W 1830 nt5.55□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 ENT2YLR206W 1842 nt5.55□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 NMD4YLR363C 657 nt5.54□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 ARA2YMR041C 1008 nt5.54□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 STB5YHR178W 2232 nt5.54□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 THP1YOL072W 1368 nt5.54□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 PRS1YKL181W 1284 nt5.54□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 BUD7YOR299W 2241 nt5.53□□□□□ -1.52
TOM1Q03280 MID2YLR332W 1131 nt5.52□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 YCR023CYCR023C 1836 nt5.52□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 PGA2YNL149C 390 nt5.52□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 ECM3YOR092W 1842 nt5.52□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 MTF1YMR228W 1026 nt5.52□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 MLC2YPR188C 492 nt5.52□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 HXT15YDL245C 1704 nt5.52□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 HXT16YJR158W 1704 nt5.52□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 APM2YHL019C 1818 nt5.51□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 PRY3YJL078C 2646 nt5.51□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 SCO2YBR024W 906 nt5.5□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 MID1YNL291C 1647 nt5.5□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 MOD5YOR274W 1287 nt5.5□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.5□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.5□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 MDG1YNL173C 1101 nt5.5□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 APS1YLR170C 471 nt5.49□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 AIM34YMR003W 597 nt5.49□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 UMP1YBR173C 447 nt5.49□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 DCC1YCL016C 1143 nt5.49□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 MAL13YGR288W 1422 nt5.49□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 RQC1YDR333C 2172 nt5.49□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 MRS3YJL133W 945 nt5.49□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 IMA2YOL157C 1770 nt5.48□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 FRT2YAL028W 1587 nt5.48□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 BPL1YDL141W 2073 nt5.48□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 YMR253CYMR253C 1245 nt5.48□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 NPP1YCR026C 2229 nt5.48□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 ATE1YGL017W 1512 nt5.48□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 SFP1YLR403W 2052 nt5.48□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 HRP1YOL123W 1605 nt5.48□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 ICY2YPL250C 411 nt5.47□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 PRP24YMR268C 1335 nt5.47□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 DPB4YDR121W 591 nt5.47□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 NSG1YHR133C 876 nt5.47□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 OAC1YKL120W 975 nt5.47□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 FUN19YAL034C 1242 nt5.47□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 SSK1YLR006C 2139 nt5.46□□□□□ -1.53
TOM1Q03280 OTU1YFL044C 906 nt5.46□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 COX4YGL187C 468 nt5.46□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 YDR282CYDR282C 1245 nt5.46□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 IFA38YBR159W 1044 nt5.46□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 ATP1YBL099W 1638 nt5.46□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 YDR445CYDR445C 408 nt5.45□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 AIF1YNR074C 1137 nt5.45□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 SGV1YPR161C 1974 nt5.45□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 YPL191CYPL191C 1083 nt5.45□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 QDR1YIL120W 1692 nt5.45□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 FET4YMR319C 1659 nt5.45□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 TSL1YML100W 3297 nt5.44□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 BAP2YBR068C 1830 nt5.44□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 PDC1YLR044C 1692 nt5.44□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 RCR2YDR003W 633 nt5.44□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 NOP16YER002W 696 nt5.44□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 UFD1YGR048W 1086 nt5.44□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 MND2YIR025W 1107 nt5.44□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 YFL042CYFL042C 2025 nt5.44□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 RPL21BYPL079W 483 nt5.43□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 RDN37-1RDN37-1 5354 nt5.43□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 RDN37-2RDN37-2 5354 nt5.43□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 YPT32YGL210W 669 nt5.43□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 CIN5YOR028C 888 nt5.43□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 YGL214WYGL214W 486 nt5.42□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 CIR2YOR356W 1896 nt5.42□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 RRN9YMR270C 1098 nt5.42□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 GPM3YOL056W 912 nt5.42□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 YTA12YMR089C 2478 nt5.42□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 HXT4YHR092C 1731 nt5.42□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 ISY1YJR050W 708 nt5.42□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 PRO2YOR323C 1371 nt5.41□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 SSH4YKL124W 1740 nt5.41□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 MAS1YLR163C 1389 nt5.41□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 NGR1YBR212W 2019 nt5.41□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 UBI4YLL039C 1146 nt5.41□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 RPB7YDR404C 516 nt5.4□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 MET16YPR167C 786 nt5.4□□□□□ -1.54
TOM1Q03280 YML133CYML133C 4125 nt5.4□□□□□ -1.55
TOM1Q03280 YOR389WYOR389W 1875 nt5.4□□□□□ -1.55
TOM1Q03280 IMA5YJL216C 1746 nt5.39□□□□□ -1.55
TOM1Q03280 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt5.39□□□□□ -1.55
TOM1Q03280 YJL215CYJL215C 360 nt5.39□□□□□ -1.55
TOM1Q03280 ICL2YPR006C 1728 nt5.39□□□□□ -1.55
TOM1Q03280 RPL12AYEL054C 498 nt5.39□□□□□ -1.55
TOM1Q03280 PLP2YOR281C 861 nt5.39□□□□□ -1.55
TOM1Q03280 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt5.38□□□□□ -1.55
TOM1Q03280 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt5.38□□□□□ -1.55
TOM1Q03280 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.2 ms