Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPCAP84074 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPCAP84074 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPCAP84074 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPCAP84074 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPCAP84074 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPCAP84074 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPCAP84074 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPCAP84074 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPCAP84074 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPCAP84074 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPCAP84074 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPCAP84074 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPCAP84074 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPCAP84074 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPCAP84074 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPCAP84074 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPCAP84074 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPCAP84074 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPCAP84074 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPCAP84074 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPCAP84074 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPCAP84074 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPCAP84074 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPCAP84074 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPCAP84074 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPCAP84074 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPCAP84074 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPCAP84074 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPCAP84074 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPCAP84074 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPCAP84074 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPCAP84074 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPCAP84074 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPCAP84074 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPCAP84074 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPCAP84074 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPCAP84074 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPCAP84074 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPCAP84074 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPCAP84074 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPCAP84074 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPCAP84074 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPCAP84074 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPCAP84074 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPCAP84074 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPCAP84074 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPCAP84074 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPCAP84074 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPCAP84074 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPCAP84074 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPCAP84074 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPCAP84074 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPCAP84074 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPCAP84074 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPCAP84074 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPCAP84074 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPCAP84074 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPCAP84074 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPCAP84074 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPCAP84074 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPCAP84074 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPCAP84074 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPCAP84074 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPCAP84074 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPCAP84074 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPCAP84074 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPCAP84074 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPCAP84074 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPCAP84074 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPCAP84074 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPCAP84074 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPCAP84074 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPCAP84074 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPCAP84074 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPCAP84074 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPCAP84074 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPCAP84074 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPCAP84074 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPCAP84074 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPCAP84074 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPCAP84074 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPCAP84074 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPCAP84074 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPCAP84074 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPCAP84074 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPCAP84074 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPCAP84074 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPCAP84074 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPCAP84074 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.7 ms