Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COG7P83436 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG7P83436 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG7P83436 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG7P83436 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG7P83436 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG7P83436 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG7P83436 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG7P83436 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG7P83436 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG7P83436 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG7P83436 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COG7P83436 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG7P83436 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG7P83436 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG7P83436 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG7P83436 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG7P83436 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG7P83436 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG7P83436 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG7P83436 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG7P83436 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG7P83436 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG7P83436 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG7P83436 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG7P83436 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG7P83436 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG7P83436 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG7P83436 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG7P83436 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG7P83436 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG7P83436 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG7P83436 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG7P83436 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG7P83436 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG7P83436 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG7P83436 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG7P83436 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG7P83436 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG7P83436 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG7P83436 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COG7P83436 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG7P83436 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG7P83436 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COG7P83436 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG7P83436 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG7P83436 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG7P83436 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG7P83436 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG7P83436 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG7P83436 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG7P83436 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG7P83436 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COG7P83436 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG7P83436 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG7P83436 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG7P83436 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG7P83436 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG7P83436 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG7P83436 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG7P83436 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG7P83436 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG7P83436 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG7P83436 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG7P83436 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG7P83436 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG7P83436 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG7P83436 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG7P83436 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG7P83436 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG7P83436 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG7P83436 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG7P83436 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG7P83436 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG7P83436 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG7P83436 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG7P83436 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG7P83436 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG7P83436 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG7P83436 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG7P83436 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG7P83436 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG7P83436 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG7P83436 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG7P83436 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG7P83436 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG7P83436 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG7P83436 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG7P83436 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG7P83436 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG7P83436 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG7P83436 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG7P83436 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COG7P83436 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG7P83436 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG7P83436 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG7P83436 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG7P83436 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COG7P83436 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG7P83436 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms