Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP5P82980 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP5P82980 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP5P82980 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP5P82980 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBP5P82980 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP5P82980 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP5P82980 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP5P82980 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP5P82980 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP5P82980 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP5P82980 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP5P82980 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP5P82980 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBP5P82980 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBP5P82980 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBP5P82980 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP5P82980 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP5P82980 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP5P82980 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP5P82980 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP5P82980 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP5P82980 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBP5P82980 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP5P82980 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP5P82980 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP5P82980 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP5P82980 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP5P82980 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP5P82980 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP5P82980 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBP5P82980 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBP5P82980 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBP5P82980 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBP5P82980 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBP5P82980 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBP5P82980 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBP5P82980 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBP5P82980 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP5P82980 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP5P82980 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP5P82980 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP5P82980 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP5P82980 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP5P82980 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP5P82980 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP5P82980 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBP5P82980 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP5P82980 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP5P82980 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP5P82980 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP5P82980 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP5P82980 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBP5P82980 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBP5P82980 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBP5P82980 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBP5P82980 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBP5P82980 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP5P82980 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP5P82980 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP5P82980 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP5P82980 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBP5P82980 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP5P82980 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP5P82980 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP5P82980 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP5P82980 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP5P82980 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP5P82980 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBP5P82980 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBP5P82980 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBP5P82980 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBP5P82980 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RBP5P82980 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBP5P82980 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms