Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT83P78385 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT83P78385 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT83P78385 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT83P78385 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT83P78385 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT83P78385 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT83P78385 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT83P78385 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT83P78385 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT83P78385 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT83P78385 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT83P78385 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT83P78385 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT83P78385 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT83P78385 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT83P78385 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT83P78385 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT83P78385 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT83P78385 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT83P78385 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT83P78385 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT83P78385 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT83P78385 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT83P78385 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT83P78385 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT83P78385 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT83P78385 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT83P78385 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT83P78385 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT83P78385 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT83P78385 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT83P78385 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT83P78385 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT83P78385 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT83P78385 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT83P78385 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT83P78385 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT83P78385 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT83P78385 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT83P78385 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT83P78385 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT83P78385 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT83P78385 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT83P78385 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT83P78385 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT83P78385 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT83P78385 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT83P78385 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT83P78385 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT83P78385 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT83P78385 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT83P78385 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT83P78385 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT83P78385 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT83P78385 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT83P78385 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT83P78385 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT83P78385 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT83P78385 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT83P78385 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT83P78385 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT83P78385 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT83P78385 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT83P78385 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT83P78385 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT83P78385 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT83P78385 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT83P78385 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT83P78385 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT83P78385 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT83P78385 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT83P78385 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT83P78385 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT83P78385 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT83P78385 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT83P78385 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT83P78385 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT83P78385 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT83P78385 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT83P78385 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT83P78385 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT83P78385 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT83P78385 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT83P78385 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT83P78385 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT83P78385 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT83P78385 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT83P78385 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms