Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARF6P62330 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARF6P62330 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARF6P62330 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ARF6P62330 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARF6P62330 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARF6P62330 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARF6P62330 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ARF6P62330 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ARF6P62330 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARF6P62330 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARF6P62330 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARF6P62330 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARF6P62330 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARF6P62330 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARF6P62330 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ARF6P62330 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ARF6P62330 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARF6P62330 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ARF6P62330 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARF6P62330 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARF6P62330 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARF6P62330 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARF6P62330 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ARF6P62330 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARF6P62330 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARF6P62330 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARF6P62330 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ARF6P62330 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARF6P62330 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ARF6P62330 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARF6P62330 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARF6P62330 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF6P62330 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF6P62330 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF6P62330 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF6P62330 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF6P62330 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF6P62330 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF6P62330 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF6P62330 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARF6P62330 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF6P62330 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARF6P62330 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms