Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFM1P61960 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFM1P61960 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFM1P61960 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFM1P61960 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFM1P61960 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFM1P61960 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFM1P61960 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFM1P61960 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UFM1P61960 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFM1P61960 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFM1P61960 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UFM1P61960 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFM1P61960 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFM1P61960 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFM1P61960 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFM1P61960 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFM1P61960 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFM1P61960 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFM1P61960 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFM1P61960 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFM1P61960 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFM1P61960 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFM1P61960 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFM1P61960 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFM1P61960 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFM1P61960 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFM1P61960 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFM1P61960 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFM1P61960 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UFM1P61960 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UFM1P61960 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFM1P61960 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFM1P61960 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFM1P61960 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFM1P61960 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFM1P61960 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFM1P61960 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFM1P61960 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFM1P61960 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFM1P61960 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFM1P61960 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFM1P61960 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UFM1P61960 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFM1P61960 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFM1P61960 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFM1P61960 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFM1P61960 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFM1P61960 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFM1P61960 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFM1P61960 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFM1P61960 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFM1P61960 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFM1P61960 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFM1P61960 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFM1P61960 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFM1P61960 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFM1P61960 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFM1P61960 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFM1P61960 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFM1P61960 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFM1P61960 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFM1P61960 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFM1P61960 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFM1P61960 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFM1P61960 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFM1P61960 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFM1P61960 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFM1P61960 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFM1P61960 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFM1P61960 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFM1P61960 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFM1P61960 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFM1P61960 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFM1P61960 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFM1P61960 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFM1P61960 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFM1P61960 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFM1P61960 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFM1P61960 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UFM1P61960 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFM1P61960 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFM1P61960 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFM1P61960 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFM1P61960 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFM1P61960 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFM1P61960 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms