Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
DEFA3P59666 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA3P59666 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms