Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
DEFA1P59665 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA1P59665 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms