Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF3P57682 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF3P57682 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLF3P57682 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLF3P57682 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLF3P57682 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLF3P57682 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF3P57682 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF3P57682 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF3P57682 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF3P57682 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF3P57682 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF3P57682 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF3P57682 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLF3P57682 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF3P57682 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF3P57682 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF3P57682 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF3P57682 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF3P57682 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLF3P57682 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLF3P57682 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLF3P57682 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF3P57682 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF3P57682 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF3P57682 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms