Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A3P57103 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC8A3P57103 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms